المهام الأساسية للوحدة:
-  الرقابة الإدارية والتشغيلية، وتقويم الأداء.
-  التدقيق.
-  رقابة الالتزام.
-  الرقابة المالية.
-  تقديم المشورة والدعم لوحدات الجامعة، ومستويات الإدارة فيها.